John Myung est né le 24 Janvier 1967 à Chicago dans l'Illinois et a déménagé à Long Island, New York, avec sa famille alors qu'il n'était encore qu'un enfant.

Sa mère étant une grande fan de musique classique, il commença le violon à l'âge de 5 ans.

A l'âge de 15 ans, son voisin lui fait découvrir la basse pour le faire jouer dans son groupe, prétextant que dans la mesure ou il avait aussi 4 cordes sur son violon, il apprendrait facilement.
Bien que les 2 instruments soient totalement différents, John se mit à la basse très rapidement et ne toucha plus à son violon par la suite.

Ses influences sont Chris Squire (Yes), Steve Harris (Iron Maiden) et Geddy Lee (Rush). Il est aussi fan de groupes tels que Jane's Addiction,